粪便微生物群移植治疗耐药菌群的疗效及疗效预测

来源:医博士  | 2021-03-01    


在过去的几十年里,由于微生物群落的不断恶化,人类肠道受到了抗生素的不断破坏。肠道微生物群的改变与肠易激综合征、炎症性肠病、哮喘、过敏性疾病、心血管疾病、代谢综合征、自身免疫性疾病,甚至神经系统疾病均有关。

 

粪便微生物群移植(FMT)是将健康供者的肠道微生物群转移到受者体内,以恢复其良好的微生物群落。肠道生物多样性的恢复和共生菌特定菌株的引入往往会取代致病菌株,导致非殖民化,从而治疗各种疾病。例如,FMT已成为治疗复发性艰难梭状芽孢杆菌的一种高效治疗方法,总治愈率超过90%。

 

多药耐药微生物(MDRO)患病率的逐年上升增加了不良临床结果的发生率,延长了住院时间,并提高了医疗成本。然而,治疗MDRO感染的方法仍然有限,效果较差。本研究评估了FMT消除MDROs肠道定植的效果,并确定了揭示可用于预测受体对FMT反应的微生物和功能标记物。

 

本研究是一项前瞻性、开放性、非对照、单中心队列研究。受试者于2018年4月至2020年1月在韩国首尔的一家三级医院注册。医院每周对所有患者进行潜在候选人筛选,并在有合适人选的情况下进行登记并知情同意。从健康无血缘关系的捐赠者身上获得的粪便溶液被注入到被产碳青霉烯酶的肠杆菌(CPE)、万古霉素耐药肠球菌(VRE)或CPE和VRE共同定植的受试者的肠道中。收集受试者的粪便样本,评估FMT前后的微生物群落变化。主要结果是非殖民化是否在FMT后一年内发生。次要结果包括非殖民化和安全的时间。肠道非殖民化被定义为连续两次聚合酶链反应(PCR)和培养阴性。应答者被定义为非殖民化的患者,而无应答者则是那些没有反应的人。

 

研究结果提示,共有35名参与者被纳入研究并接受FMT,其中4名CPE患者,19名VRE患者,12名患者为CPE联合VRE。5例为小儿,30例为成人。肺炎克雷伯菌(n=14)是CPE最常见的肠道细菌,而肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶(n=14)是最常见的碳青霉烯酶亚类。VRE最常见的肠球菌及其遗传类型分别为粪肠球菌(n=15)和VanA(n=27)。

 

参与者的中位年龄为66.5岁(IQR=25),22名参与者为男性(62.9%)。VRE对FMT的反应最差(10(41.7%)VRE vs.3(12.5%)CPE vs.11(45.8%)CPE/VRE,p=0.056)。FMT前MDRO携带的中位持续时间为44天(IQR=38),FMT后平均住院时间为68.8±71.8天。在FMT、供体类型和FMT方法上,应答者和无应答者之间无显著差异。

 

35例患者中有24例(68.6%)在接受FMT后1年内被非殖民化。多元变量分析显示,FMT(FMT:危险比(HR)= 5.343,95%置信区间(CI)= 1.877-15.212,p = 0.002)及MDRO类型(CPE:HR = 11.146,95%CI = 2.420-51.340, p = 0.002; CPE / VRE:HR = 2.948,95%CI = 1.200-7.246,p = 0.018; VRE作为参考)是与非殖民化时间相关的重要独立因素。

 

微生物群落分析显示,在FMT导致VRE非殖民化之前,生物多样性和丰富度较高。分支梭状芽孢杆菌、厌氧杆菌属和艾森伯格菌可作为分类生物标志物,K02017可作为VRE清除的功能性生物标志物。

 

通过本研究可发现FMT是一种有效解除MDRO定植的方法,其非殖民化效果可通过微生物组分析来预测。

 

医博士编译自:Seong H, Lee SK, Cheon JH, et al. Fecal Microbiota Transplantation for multidrug-resistant organism: Efficacy and Response prediction. The Journal of Infection. 2020; 81(5):719-725.


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