长链非编码 RNA 作为妊娠期肝内胆汁淤积症潜在新型生物标志物的诊断和预后价值

来源:医博士  | 2022-02-24 作者:李胜佳    


妊娠期肝内胆汁淤积症 (ICP) 的特点是肝酶升高、血清胆汁酸升高和瘙痒。ICP 患者发生自发性胎儿窘迫、宫内猝死和早产的风险很高。遗传和环境因素都参与了 ICP 病因的解释。

 

对 ICP 的几项研究揭示了许多作用部位的基因和蛋白质发生改变,包括氧化应激、细胞生长、细胞凋亡、脂质代谢和免疫反应。目前,ICP的鉴别主要通过症状和血清总胆汁酸(TBA)水平来确定。但其特异性仍然有限。因此,ICP的快速诊治在产科中具有重要意义。

 

长链非编码 RNA (lncRNA) 在过去的十年中,被广泛认为是癌症、心血管疾病和类风湿病等各种疾病的重要调节因子。它们参与许多病理和生理过程,例如染色质重塑、细胞周期进程、转录后加工和基因转录。据报道,一些 lncRNA 在多种癌症中高表达,使其成为一种很有前途的疾病诊断工具。还有报道称一些lncRNAs与患者生存相关,这使得它们适合于癌症的预后。迄今为止,lncRNAs在ICP中的作用及相关机制仍未完全阐明。

 

既往研究已经发现 linc02527 在 ICP 患者的胎盘和血清中上调,使用HTR8细胞进行的体外实验显示,linc02527促进自噬和细胞增殖,这表明linc02527可能是ICP治疗的潜在靶点。然而,lncRNAs与ICP的发生发展的关系尚不明确,阐明lncRNAs在ICP中的定位可能有助于了解ICP的发病机制,并可能为ICP的诊断、治疗和预后提供新的决定因素。

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在本研究中,研究者使用 ICP 患者的血清研究了 lncRNA 的表达谱,并探讨了不同表达的lncRNAs在ICP中的诊断和预后价值。

 

本研究招募了2016年10月至2017年9月南京医科大学无锡市妇幼保健院54名ICP孕妇和54名健康孕妇,通过对照研究以鉴定用于 ICP 诊断和预后的母体血清 lncRNA。

 

使用 CapitalBio Technology Human lncRNA Array v4.0 比较 ICP 患者和健康对照的表达谱。微阵列筛选的分层聚类分析、散点图和火山图显示,与HC组相比,ICP组有58个上调和85个下调的lncRNA,47个上调和71个下调的mRNA。从143个差异表达的lncRNAs中,选择5个差异表达的lncRNAs进行qRT-PCR检测,因为它们的表达在组内差异不大,但在组间差异显著。其中ICP组血清中未检测到RNA95791和RNS873。与对照组相比,ICP组的另外三个lncRNAs ENST000050575.1、ASO3480和ENST0000449605显著下调。

 

为了找到差异表达的 lncRNA 和 mRNA 的生物功能可能的富集,使用基因本体(GO) 术语进行了通路分析。结果表明,显著富集的术语包括细胞周期过程、脂肪酸代谢过程、凋亡信号通路和氧化应激。此外,ICP组中异常表达的mRNA为HAND1(心脏和神经嵴衍生表达蛋白1)、MRPS16和AQP2(水通道蛋白2)。结果揭示了ICP中差异表达的lncRNAs和mRNAs的相关性。

 

为评价lncRNAs的诊断价值,采用Pearson相关分析法分析ENST0000505175.1、ASO3480、ENST0000449605.1和TBA之间的相关性。结果表明,ENST0000505175.1、ASO3480和ENST0000449605.1水平与TBA呈正相关(分别为R=0.401,P<0.0001;R=0.319,P=0.0009;R=0.300,P=0.0018)。并对lncRNAs诊断ICP的敏感性和特异性进行了评价。

 

ENST0000505175.1/ASO3480/ENST0000449605.1的ROC曲线显示ICP组和非ICP组之间有很强的分离,曲线下面积(AUC)ENST00005055175.1为0.731(95%置信区间0.566-0.897),ASO3480为0.798(95%置信区间0.661-0.934),ENST0000449605.1为0.812(95%置信区间0.675-0.948),ENST0000505175.1/ASO3480/ENST0000449605.1为0.865(95%置信区间0.756-0.974)。提示这3个lncRNA对ICP具有诊断价值,可作为TBA诊断的补充。

 

为了评估lncRNAs的预后价值,采用卡方检验分析ENST0000505175.1、ASO3480、ENST0000449605.1与ICP围产儿结局之间的关系。通过log2转化使lncRNA表达正常化。低lncRNA表达组的围产儿结局较差,提示这三种lncRNAs对ICP有预测价值,可作为ICP治疗的潜在监测指标。

 

综上所述,三种 lncRNA 的血清水平可作为 ICP 的潜在生物标志物。将血清 lncRNA 水平与 ICP 常用的临床标志物(如 TBA、丙氨酸氨基转移酶和甘氨胆酸)相结合,可能会改善 ICP 的诊断,值得进一步研究。

 

医博士编译自:Zou S, Zhao S, Wang J, et al. Diagnostic and Prognostic Value of Long Noncoding RNAs as Potential Novel Biomarkers in Intrahepatic Cholestasis of Pregnancy. Biomed Research International. 2021; 2021:8858326. doi:10.1155/2021/8858326.  

原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33728343/  


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